MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 plasmid pCM1

Total Repeats: 683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009478	GC	3	6	34	39	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009478	CGG	2	6	122	127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009478	CCG	2	6	128	133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009478	GCC	2	6	134	139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_009478	CGG	2	6	228	233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009478	GGT	2	6	237	242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009478	GAC	2	6	294	299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009478	GGTGTC	2	12	309	320	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009478	TCG	2	6	323	328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009478	CG	3	6	330	335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009478	GCC	2	6	343	348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009478	GCA	2	6	465	470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009478	GGC	2	6	556	561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009478	GTG	2	6	625	630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009478	CG	3	6	735	740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009478	CGC	2	6	778	783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_009478	CGG	2	6	853	858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009478	CGA	2	6	863	868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009478	CAGC	2	8	885	892	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009478	CCGT	2	8	905	912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009478	CCG	2	6	957	962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_009478	C	6	6	970	975	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_009478	GACCA	2	10	1005	1014	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_009478	GCCG	2	8	1019	1026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009478	GCAGC	2	10	1115	1124	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_009478	CCGA	2	8	1182	1189	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009478	TAGAA	2	10	1241	1250	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009478	GGGT	2	8	1301	1308	0 %	25 %	75 %	0 %	148245184
29	NC_009478	CGA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245184
30	NC_009478	GTCC	2	8	1372	1379	0 %	25 %	25 %	50 %	148245184
31	NC_009478	AGG	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148245184
32	NC_009478	TGA	2	6	1460	1465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245184
33	NC_009478	CA	3	6	1469	1474	50 %	0 %	0 %	50 %	148245185
34	NC_009478	ACG	2	6	1478	1483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245185
35	NC_009478	TGG	2	6	1507	1512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245185
36	NC_009478	TCGC	2	8	1555	1562	0 %	25 %	25 %	50 %	148245185
37	NC_009478	GAG	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148245185
38	NC_009478	CAT	2	6	1587	1592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245185
39	NC_009478	GCCGC	2	10	1606	1615	0 %	0 %	40 %	60 %	148245185
40	NC_009478	CG	3	6	1704	1709	0 %	0 %	50 %	50 %	148245185
41	NC_009478	CGC	2	6	1725	1730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245185
42	NC_009478	AGC	2	6	1754	1759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245185
43	NC_009478	CAG	2	6	1809	1814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245185
44	NC_009478	GTTA	2	8	1892	1899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009478	GAC	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009478	GTAG	2	8	1953	1960	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009478	AC	4	8	2003	2010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009478	GGAAG	2	10	2047	2056	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009478	TCG	2	6	2066	2071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245186
50	NC_009478	GCA	2	6	2079	2084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245186
51	NC_009478	ACC	2	6	2104	2109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245186
52	NC_009478	CGA	2	6	2250	2255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245186
53	NC_009478	CG	3	6	2256	2261	0 %	0 %	50 %	50 %	148245186
54	NC_009478	GCA	2	6	2287	2292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245186
55	NC_009478	ATC	2	6	2308	2313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245186
56	NC_009478	CTG	2	6	2482	2487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245186
57	NC_009478	CG	3	6	2489	2494	0 %	0 %	50 %	50 %	148245186
58	NC_009478	GCA	2	6	2511	2516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245186
59	NC_009478	GACGA	2	10	2527	2536	40 %	0 %	40 %	20 %	148245186
60	NC_009478	CG	3	6	2538	2543	0 %	0 %	50 %	50 %	148245186
61	NC_009478	CGA	2	6	2547	2552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245186
62	NC_009478	CGT	2	6	2592	2597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245186
63	NC_009478	GCG	2	6	2621	2626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245186
64	NC_009478	TCC	2	6	2680	2685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245186
65	NC_009478	GGAA	2	8	2719	2726	50 %	0 %	50 %	0 %	148245186
66	NC_009478	CAA	2	6	2762	2767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148245187
67	NC_009478	GAA	2	6	2802	2807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245187
68	NC_009478	CTG	2	6	2848	2853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245187
69	NC_009478	GAAGG	2	10	2868	2877	40 %	0 %	60 %	0 %	148245187
70	NC_009478	ATC	2	6	2968	2973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245187
71	NC_009478	GTC	2	6	3096	3101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
72	NC_009478	TCGT	2	8	3154	3161	0 %	50 %	25 %	25 %	148245188
73	NC_009478	TCG	2	6	3173	3178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
74	NC_009478	AGT	2	6	3190	3195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245188
75	NC_009478	TCA	2	6	3200	3205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245188
76	NC_009478	GTG	2	6	3234	3239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245188
77	NC_009478	TCG	2	6	3251	3256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
78	NC_009478	TCGC	2	8	3286	3293	0 %	25 %	25 %	50 %	148245188
79	NC_009478	CTG	2	6	3313	3318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
80	NC_009478	CGGG	2	8	3386	3393	0 %	0 %	75 %	25 %	148245188
81	NC_009478	GCT	2	6	3399	3404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
82	NC_009478	CGC	2	6	3435	3440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245188
83	NC_009478	CGA	2	6	3448	3453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245188
84	NC_009478	GCC	2	6	3476	3481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245188
85	NC_009478	AGG	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148245188
86	NC_009478	GC	3	6	3525	3530	0 %	0 %	50 %	50 %	148245188
87	NC_009478	CGG	2	6	3542	3547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245188
88	NC_009478	TCG	2	6	3590	3595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
89	NC_009478	GCC	2	6	3616	3621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245188
90	NC_009478	GGTG	2	8	3623	3630	0 %	25 %	75 %	0 %	148245188
91	NC_009478	CCG	2	6	3693	3698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245188
92	NC_009478	CTT	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245188
93	NC_009478	TGC	3	9	3869	3877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
94	NC_009478	TGC	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
95	NC_009478	TGTGGG	2	12	3911	3922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245188
96	NC_009478	TGA	3	9	3935	3943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245188
97	NC_009478	GGT	2	6	3951	3956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245188
98	NC_009478	ACGCCG	2	12	3980	3991	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148245188
99	NC_009478	CGG	2	6	4012	4017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245188
100	NC_009478	CGG	2	6	4038	4043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245188
101	NC_009478	CGA	2	6	4137	4142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245188
102	NC_009478	GC	3	6	4144	4149	0 %	0 %	50 %	50 %	148245188
103	NC_009478	CCT	2	6	4161	4166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245188
104	NC_009478	GGT	2	6	4229	4234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245188
105	NC_009478	TGCG	2	8	4298	4305	0 %	25 %	50 %	25 %	148245188
106	NC_009478	GCG	3	9	4303	4311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245188
107	NC_009478	CGA	2	6	4371	4376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245188
108	NC_009478	GC	3	6	4475	4480	0 %	0 %	50 %	50 %	148245188
109	NC_009478	TGT	2	6	4499	4504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245188
110	NC_009478	CGA	2	6	4512	4517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245188
111	NC_009478	ACC	3	9	4537	4545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245188
112	NC_009478	CGC	2	6	4560	4565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245188
113	NC_009478	GCTG	2	8	4569	4576	0 %	25 %	50 %	25 %	148245188
114	NC_009478	CGC	2	6	4611	4616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245188
115	NC_009478	TCCC	2	8	4621	4628	0 %	25 %	0 %	75 %	148245188
116	NC_009478	CAG	2	6	4665	4670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245188
117	NC_009478	GTC	2	6	4684	4689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
118	NC_009478	GGC	2	6	4713	4718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245188
119	NC_009478	TCGC	2	8	4723	4730	0 %	25 %	25 %	50 %	148245188
120	NC_009478	CGAG	2	8	4766	4773	25 %	0 %	50 %	25 %	148245188
121	NC_009478	CG	3	6	4891	4896	0 %	0 %	50 %	50 %	148245188
122	NC_009478	CCGAC	2	10	4920	4929	20 %	0 %	20 %	60 %	148245188
123	NC_009478	CGTCGA	2	12	4944	4955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148245188
124	NC_009478	CGA	2	6	4965	4970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245188
125	NC_009478	AGC	2	6	4976	4981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245188
126	NC_009478	GCAGCG	2	12	4987	4998	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148245188
127	NC_009478	GACGGC	2	12	5052	5063	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148245188
128	NC_009478	CGA	3	9	5091	5099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245188
129	NC_009478	GC	3	6	5110	5115	0 %	0 %	50 %	50 %	148245188
130	NC_009478	ACG	2	6	5128	5133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245188
131	NC_009478	GCCG	2	8	5142	5149	0 %	0 %	50 %	50 %	148245188
132	NC_009478	GTG	2	6	5163	5168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245188
133	NC_009478	TCC	2	6	5170	5175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245188
134	NC_009478	CGT	2	6	5253	5258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
135	NC_009478	GC	3	6	5266	5271	0 %	0 %	50 %	50 %	148245188
136	NC_009478	TCC	2	6	5330	5335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_009478	TCG	2	6	5382	5387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009478	ATG	2	6	5396	5401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009478	GCG	2	6	5468	5473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009478	GGT	2	6	5482	5487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009478	ATG	2	6	5501	5506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009478	TCGA	2	8	5847	5854	25 %	25 %	25 %	25 %	148245189
143	NC_009478	CGGAAC	2	12	5903	5914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245189
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147	NC_009478	TGTA	2	8	6094	6101	25 %	50 %	25 %	0 %	148245189
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161	NC_009478	TCC	2	6	6772	6777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_009478	GTG	2	6	6955	6960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009478	GCA	2	6	6985	6990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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